十幾年來(lái)，綠色食品發(fā)展中心在農(nóng)業(yè)部的支持下，采取邊制定，邊試行，邊修訂的方法，使綠色食品標(biāo)準(zhǔn)體系在實(shí)踐中不斷被修正和完善，迄今，共發(fā)布通用性準(zhǔn)則、產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)等72項(xiàng)國(guó)家農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)。同時(shí)，地方綠色食品管理機(jī)構(gòu)還制定了數(shù)十項(xiàng)地方標(biāo)準(zhǔn)，有效地補(bǔ)充了綠色食品標(biāo)準(zhǔn)體系。
1.綠色食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)
《綠色食品產(chǎn)地環(huán)境技術(shù)條件》（NY/T391-2000），根據(jù)農(nóng)業(yè)生態(tài)的特點(diǎn)和綠色食品生產(chǎn)對(duì)生態(tài)環(huán)境的要求，依據(jù)現(xiàn)有國(guó)家環(huán)保標(biāo)準(zhǔn)，對(duì)控制項(xiàng)目進(jìn)行優(yōu)選。它規(guī)范了綠色食品產(chǎn)地環(huán)境質(zhì)量調(diào)查、監(jiān)測(cè)、評(píng)價(jià)的主要內(nèi)容、方法，規(guī)定了大氣環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、農(nóng)田灌溉水水質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)、漁業(yè)水質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)、畜禽飼養(yǎng)用水標(biāo)準(zhǔn)和土壤環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的各項(xiàng)指標(biāo)及濃度限值、監(jiān)測(cè)和評(píng)價(jià)方法。其附錄中還提出了綠色食品產(chǎn)地土壤肥力分級(jí)和土壤質(zhì)量綜合評(píng)價(jià)方法。
2.綠色食品生產(chǎn)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)
綠色食品生產(chǎn)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)是綠色食品標(biāo)準(zhǔn)體系的核心內(nèi)容，分為三個(gè)層次：綠色食品生產(chǎn)的通用準(zhǔn)則；綠色食品生產(chǎn)操作規(guī)程；綠色食品生產(chǎn)作業(yè)歷。
綠色食品生產(chǎn)的通用準(zhǔn)則是對(duì)生產(chǎn)綠色食品過(guò)程中物質(zhì)投入的一個(gè)原則性規(guī)定，適用，既是綠色食品生產(chǎn)、認(rèn)證、監(jiān)督檢查的主要依據(jù)，也是綠色食品質(zhì)量信譽(yù)的。目前，作為中華人民共和國(guó)農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)發(fā)布的準(zhǔn)則有：《綠色食品食品添加劑使用準(zhǔn)則》NY/T392-2000；《綠色食品農(nóng)藥使用準(zhǔn)則》NY/T393-2000；《綠色食品肥料使用準(zhǔn)則》NY/T394-2000；《綠色食品飼料及飼料添加劑使用準(zhǔn)則》NY/T471-2001；《綠色食品獸藥使用準(zhǔn)則》NY/T472-2001；《綠色食品動(dòng)物衛(wèi)生準(zhǔn)則》NY/T473-2001；《綠色食品漁藥使用準(zhǔn)則》NY/T755-2003。在這些準(zhǔn)則中對(duì)允許、限制和禁止使用的生產(chǎn)資料及其使用方法、使用劑量、使用次數(shù)、休藥期等做出了明確的規(guī)定，從而為截?cái)嗌a(chǎn)中的污染源，確保產(chǎn)地和產(chǎn)品不受污染提供了。
綠色食品生產(chǎn)操作規(guī)程是確保綠色食品產(chǎn)品質(zhì)量的主要措施，包括農(nóng)作物種植、畜禽飼養(yǎng)、水產(chǎn)養(yǎng)殖和食品加工等操作規(guī)程，以綠色食品的通用準(zhǔn)則為依據(jù)，按不同農(nóng)業(yè)區(qū)域的生產(chǎn)特性、作物種類、畜禽種類分別制定，用于指導(dǎo)綠色食品生產(chǎn)活動(dòng)，規(guī)范綠色食品生產(chǎn)技術(shù)的技術(shù)規(guī)定，地區(qū)適用，其核心是化學(xué)投入品的使用。區(qū)域性的綠色食品生產(chǎn)操作規(guī)程目前約有數(shù)十項(xiàng)，其中，遼寧省綠色食品發(fā)展中心已經(jīng)制定了綠色食品糧油、蔬菜、水果等19項(xiàng)生產(chǎn)操作規(guī)程和4項(xiàng)畜禽產(chǎn)品養(yǎng)殖技術(shù)規(guī)程。
綠色食品生產(chǎn)作業(yè)歷是由綠色食品申報(bào)企業(yè)根據(jù)各基地的具體情況，依據(jù)綠色食品的通用準(zhǔn)則和相應(yīng)的綠色食品生產(chǎn)操作規(guī)程制定，用于指導(dǎo)種植（養(yǎng)殖）戶實(shí)際操作的“明白紙”。在遼寧省錦州地區(qū)的綠色食品蔬菜生產(chǎn)基地，每位種植戶手中都有一份“綠色食品蔬菜生產(chǎn)作業(yè)歷”，依據(jù)不同蔬菜品種的特點(diǎn)，簡(jiǎn)單而通俗地提出了綠色食品棚菜生產(chǎn)的種植要求，使千家萬(wàn)戶的生產(chǎn)過(guò)程有了統(tǒng)一的技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)指導(dǎo)。
3.綠色食品產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)
綠色食品產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)是綠色食品標(biāo)準(zhǔn)體系的重要組成部分，是衡量綠色食品終產(chǎn)品質(zhì)量的指標(biāo)尺度，它反映了綠色食品生產(chǎn)、管理及質(zhì)量控制水平，是樹(shù)立綠色食品形象的主要標(biāo)志。其內(nèi)容包括外觀品質(zhì)、營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)及衛(wèi)生品質(zhì)三部分，具體體現(xiàn)在原料、感官、理化、微生物學(xué)等四個(gè)方面的要求。
為了適應(yīng)綠色食品迅速發(fā)展的形勢(shì)，綠色食品發(fā)展中心在范圍內(nèi)組織有關(guān)技術(shù)力量，有計(jì)劃、有步驟地制（修）定了一批綠色食品產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)：1995年經(jīng)農(nóng)業(yè)部批準(zhǔn)作為農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)，首批頒布25項(xiàng)綠色食品產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)（NY/T268-1995至NY/T292-1995）；2000年頒布20項(xiàng)綠色食品產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)（NY/T418-2000至NY/T437-2000）；2002年修訂綠色食品啤酒、茶葉、乳制品的標(biāo)準(zhǔn)，頒布綠色食品白菜類蔬菜和茄果類蔬菜的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)；2003年修訂《綠色食品大豆》為《綠色食品豆類》，頒布12項(xiàng)綠色食品標(biāo)準(zhǔn)（NY/T743-2003至NY/T754-2003）。這些標(biāo)準(zhǔn)在檢測(cè)項(xiàng)目和指標(biāo)上，一般嚴(yán)于國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)，達(dá)到或接近同類產(chǎn)品的國(guó)外先進(jìn)標(biāo)準(zhǔn)或標(biāo)準(zhǔn)。
4.綠色食品包裝、標(biāo)簽、儲(chǔ)運(yùn)標(biāo)準(zhǔn)
《綠色食品包裝通用準(zhǔn)則》（NY/T658-2002），規(guī)定了綠色食品的包裝必須遵循衛(wèi)生、、不浪費(fèi)資源、不污染環(huán)境、可循環(huán)利用等原則。綠色食品標(biāo)簽除應(yīng)符合《食品標(biāo)簽通用標(biāo)準(zhǔn)》（GB7718）外，若是特殊營(yíng)養(yǎng)食品，還應(yīng)符合《特殊營(yíng)養(yǎng)食品標(biāo)簽》（GB/T13432）。標(biāo)志使用應(yīng)符合《綠色食品商標(biāo)標(biāo)志設(shè)計(jì)使用規(guī)范手冊(cè)》的要求，凡取得綠色食品標(biāo)志使用資格的單位，應(yīng)嚴(yán)格做到“四位一體”，即綠色食品的標(biāo)準(zhǔn)圖形、標(biāo)準(zhǔn)字形、編號(hào)、防偽標(biāo)簽。綠色食品發(fā)展中心根據(jù)《綠色食品標(biāo)志管理辦法》及國(guó)家有關(guān)法規(guī)精神，要求綠色食品標(biāo)志產(chǎn)品加貼綠色食品標(biāo)志防偽標(biāo)簽。實(shí)施綠色食品標(biāo)志防偽措施，對(duì)每個(gè)使用綠色食品標(biāo)志的產(chǎn)品及整個(gè)綠色食品形象具有保護(hù)和監(jiān)控作用。