食品安全問題是現(xiàn)在人們比較關(guān)注的，對于食品生產(chǎn)環(huán)節(jié)中所出現(xiàn)的問題，政府加大力度監(jiān)督管理，為了規(guī)范全區(qū)食品、食品添加劑生產(chǎn)許可活動，加強食品生產(chǎn)監(jiān)督管理，根據(jù)新修訂《食品安全法》和《食品生產(chǎn)許可管理辦法》（國家食品藥品監(jiān)督管理總局令第16號），新疆維吾爾自治區(qū)食品藥品監(jiān)管局制定了《新疆維吾爾自治區(qū)食品生產(chǎn)許可管理實施辦法》（以下簡稱《辦法》），自2016年5月1日起施行。《辦法》共十二章、六十條，對食品生產(chǎn)許可的申請與受理、現(xiàn)場核查、許可決定、許可證管理、許可變更、延續(xù)換證、補辦、注銷等進行了規(guī)范。
與原來的規(guī)定相比，《辦法》主要有“五取消”“四調(diào)整”“四加強”方面的變化。“五取消”：一是取消部分前置審批材料核查；二是取消許可檢驗機構(gòu)指定；三是取消食品生產(chǎn)許可審查收費；四是取消委托加工備案；五是取消企業(yè)年檢和年度報告制度�！八恼{(diào)整”：一是調(diào)整食品生產(chǎn)許可主體，實行一企一證；二是調(diào)整許可證書有效期限，將食品生產(chǎn)許可證書有效期限由原來的3年延長至5年；三是調(diào)整現(xiàn)場核查內(nèi)容，申請保健食品、特殊醫(yī)學(xué)用途配方食品、嬰幼兒配方乳粉生產(chǎn)許可，在產(chǎn)品注冊時經(jīng)過現(xiàn)場核查的，可以不再進行現(xiàn)場核查；四是調(diào)整審批權(quán)限，根據(jù)食品安全風(fēng)險，將部分食品生產(chǎn)許可權(quán)限由自治區(qū)食品藥品監(jiān)管部門逐步下放至地（州、市）級食品生產(chǎn)監(jiān)管部門�！八募訌姟保阂皇羌訌娫S可檔案管理；二是加強許可后監(jiān)督檢查；三是加強審查員隊伍管理；四是加強信息化建設(shè)。
按照《辦法》規(guī)定，新獲證及換證食品生產(chǎn)企業(yè)，應(yīng)當(dāng)在食品包裝或者標(biāo)簽上標(biāo)注新的食品生產(chǎn)許可證編號，不再標(biāo)注“QS”，而是標(biāo)注“SC”（“生產(chǎn)”的漢語拼音字母縮寫）。食品生產(chǎn)企業(yè)存有的帶有“QS”標(biāo)志的包裝和標(biāo)簽，可以繼續(xù)使用至2018年10月1日。2018年10月1日起，食品生產(chǎn)企業(yè)生產(chǎn)的食品不得再使用原包裝、標(biāo)簽和“QS”標(biāo)志。